L'équipe doit arrêter le colonel Gaumont qui menace de faire exploser une centrale nucléaire. Mais Jesse est victime d'un gaz neurologique qui rend la structure de son ADN instable.
Alors que Jesse et Brennan s’introduisent dans un bâtiment militaire pour en vérifier le système de sécurité autour d’une arme très dangereuse, ils s’aperçoivent qu’un groupe armé les a précédé. Ces derniers utilisent un gaz neurotoxique pour neutraliser les gardiens et s’emparer de l’arme. Jesse qui a été exposé au gaz, perd le contrôle de ses pouvoirs.
Le groupe de terroristes s’introduit ensuit dans une centrale nucléaire et utilise le bouclier laser qu’ils ont volé pour s’assurer que personne ne pourra les attaquer. Leur chef le colonel Gaumont, un ancien militaire déclaré mort lors d’une mission secrète lance un appel pour une rançon. Le contact d’Adam au gouvernement lui demande de l’aider à empêcher le colonel de mettre son plan qui est de faire exploser la centrale, à exécution.
Adam envoi Shalimar, Brennan et Emma sur les lieux. Jesse veut s’y rendre également mais Adam refuse tant qu’il n’aura pas récupéré le contrôle de ses pouvoirs. Ils arrivent à passer le bouclier laser et à pénétrer dans la centrale. Mais à l’intérieur ils sont surpris par le manque de gardes.
En effet leur venue était attendue par le colonel, mais celui-ci semble très mécontent d’apprendre que Jesse n’est pas là.
Jesse guide Brennan jusqu’à la salle qui contrôle le système de refroidissement de la centrale là où se trouve la bombe. Mais au moment où il s’apprête à lui expliquer comment la désamorcer leur transmission est coupée. Contre l’avis d’Adam il quitte le Sanctuaire pour se rendre à la centrale. Gaumont ravi n’attendait que ça.
Brennan est surpris par le colonel qui connaissant ce qu’il est, s’arrange pour l’asperger d’eau en utilisant le système anti-incendie et Brennan s’électrocute. Shalimar et Emma arrivent et le raniment. Shalimar énervée part à la recherche de Gaumont tandis que Brennan et Emma doivent se débrouiller pour désamorcer la bombe. Il ne leur reste que 3 minutes.
Jesse s’introduit dans la centrale et en pirate les ordinateurs. Puis il rencontre Sophia Taylor une employée à qui il demande de l’aide pour déconnecter les réacteurs.
Shalimar trouve Gaumont et tente de lui prendre le détonateur mais ce dernier déclenche la bombe au grand désarroi de Brennan et Emma qui tentaient de la désamorcer.
N’ayant pas d’autre solution Jesse s’introduit au cœur du réacteur pour en retirer le tube de Xiraxium (le noyau nucléaire)
Adam comprend que Gaumont à fait tout ça pour attirer Jesse dans la centrale afin qu’il puisse récupérer le Xiraxium.
Lorsque Jesse revient avec Xiraxium, Gaumont entre dans la pièce et Sophia dévoile alors qu’elle travaille avec lui. Jesse se désintègre pour leur échapper et atterrit aux pieds de Shalimar, Emma et Brennan qui le regardent affolés alors qu’il ne parvient pas à reprendre consistance.
Sur les conseils d’Adam, Brennan crée un champ électrique autour de Jesse qui reprend enfin le contrôle de ses pouvoirs et se matérialise de nouveau.
Gaumont et Sophia tente de fuir, mais l’équipe de Mutant X les poursuit avec l’Helix. Gaumont utilise le bouclier laser mais Jesse envoi un faisceau électromagnétique pour couper leur moteur.
Ayant oublié de désactivé le bouclier laser Gaumont et Sophia sont désintégrés par celui-ci.
De retour au Sanctuaire Adam vérifie l’état de Jesse et tout rentre dans l’ordre.